التحری الجزیئی عن فایروس تجعد واصفرار اوراق الطماطه Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV) وتحدید عزلاته المنتشرة فی بعض مزارع الطماطه المحمیة فی محافظة القادسیة

الملخص
هدفت هذه الدراسة الى التحری الجزیئی عن عزلات الفایروس المسببة لمرض التجعد والاصفرار على اوراق الطماطه والمنتشرة فی بعض مزارع الطماطه المحمیة فی محافظة القادسیة ( قضاء الحمزة الشرقی ،ناحیة السدیر،ناحیة غماس وناحیة السنیة). اجری تشخیص جزیئی للفایروسات العائدة للمجموعة Begomovirus بوساطة تقانة Polymerase chain reaction(PCR) و باستعمال طقم بادئی Deng المتخصص بالجنس المذکور ومن تحدید التتابعات النیوکلیوتیدیة للفایروسات ومقارنتها مع نظیراتها الموجودة فی بنک الجینات وتحلیلها باستعمال برنامج MEGA6.أظهرت نتائج فحص PCR باستعمال طقم بادئ Dengتفاعلاً ایجابیاً اذ تم الحصول على قطع (DNA ) ذات وزن جزئی 540 زوجاً قاعدیاً تقریبا من 6 من أصل 10عینات ظهرت علیها أعراض مرض تجعد واصفرار اوراق الطماطه وهذا یشیر الى اصابتها بفایروسات تعود الى مجموعة begomoviruses. أظهر تحلیل التتابعات النیوکلیوتیدیة أعلى نسبة تطابق تراوحت بین 99.5– 96% مع عزلات کوبا (AJ223505)والولایات المتحدة الأمریکیة(AY530931) وعزلة الارض المحتلة (AB110217). ضمت شجرة الاصول الوراثیة المشکلة من التتابع النیوکلیوتیدی الجزئی للغلاف البروتینی الفایروسی جمیع العزلات قید الدراسة مع نظیراتها المسترجعة من بنک الجینات العائدة ﻟفایروس (TYLCV). اظهرت نتائج التحلیل الجزیئی وجود تغایر فی عزلات فایروس تجعد واصفرار أوراق الطماطهTomato yellow leaf curl virus (TYLCV)ضمن مناطق المسح فی المحافظة اذ تراوحت نسب التطابق بین 91-100% للتتابعات قید الدراسة والذی یشیر الى ان هذه التتابعات ربما تعود لسلالات مختلفة . لم یتم الکشف عن فایروسات أخرى ضمن مناطق المسح عند تطابق جمیع التتابعات قید الدراسة مع باقی تتابعات بنک الجینات العائدة الى ( TYLCV) فقط من بنک الجینات دون الفایروسات الاخرى . یمکن الاستدلال من نسب التطابق العالیة أن فایروس تجعد واصفرار أوراق الطماطه ربما یکون وافداً الى محافظة القادسیة، مما یتطلب إجراء دراسات أخرى تتضمن دراسات الخصائص الحیویة و الحصول على التتابعات الکـــاملة للجینوم الکلی الفایروسی للعزلات المنتشرة لتأکید هذا التغایر

الكلمات الرئيسة


السنة 8، العدد 1
حزيران / يونيو 2018
الصفحة 48-56

  • تاريخ الاستلام 01 حزيران / يونيو 2018
  • تاريخ التعديل 20 حزيران / يونيو 2018
  • تاريخ القبول 25 حزيران / يونيو 2018